遇事不慌,控制变量法帮助你
对于那些学习过tcga数据挖掘课程的朋友们来说,使用gdc工具进行tcga数据下载应该并不陌生。首先,你需要下载一个编译后的二进制可执行的gdc工具软件文件,通过简单的bing搜索就可以找到官方的下载链接,如下:
链接在:https://www.vszh.cn/link/4f5dd3a39f66fa2e54bb98577ffb4ff0
GDC工具官方下载链接
在这个过程中,你会遇到三个变量:首先是操作系统,可以选择Windows、macOS或Ubuntu;其次是系统的Python版本,可以是2.7或3。如果你在使用GDC工具下载TCGA数据时遇到报错,应该从这两个方面进行排查。
首先,控制的变量是操作系统。如果你在Windows电脑上报错,可以尝试在macOS或Ubuntu上下载对应的软件进行测试。如果你在CentOS上操作,可能会遇到如下报错:
CentOS操作系统报错
其次,需要控制的变量是Python版本。例如,我在Ubuntu操作系统上下载了对应Python3的GDC工具,就顺利完成了下载:
成功的下载
如果这两个变量都测试通过仍然无法解决问题,你还可以尝试更换你的manifest文件,因为GDC工具是根据manifest文件进行下载的。如果更换manifest文件后仍然无法成功下载,可能是你的网络问题,可以向网友求助,让大家测试你的代码。
当然,如何求助,又是另外一些技巧了。
以上就是遇事不慌,控制变量法帮助你的详细内容,更多请关注启程网【www.vszh.cn】。
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